全国高等学校総合体育大会、各都道府県予選の2016年6月6日までの結果は以下の通り。残る都道府県予選は17箇所、北海道、茨城県、栃木県、群馬県、埼玉県、千葉県、東京都、神奈川県、山梨県、岡山県、広島県、山口県、香川県、愛媛県、佐賀県、長崎県、熊本県となる。

青森県　代表校・青森山田（17年連続20回目）
[決勝]青森山田 4-0 八戸学院光星高

岩手県　代表校・盛岡商（2年ぶり21回目）
[決勝]盛岡商 3-2 盛岡中央

宮城県　代表校・仙台育英（2年ぶり17回目）
[決勝]仙台育英 3-1 東北

秋田県　代表校・秋田商（2年連続39回目）
[決勝]秋田商 2-1(延長)秋田南

山形県　代表校・山形中央（3年ぶり10回目）
[決勝]山形中央 4-0 東海大山形

福島県　代表校・尚志（7年連続9回目）
[決勝]尚志 2-0 福島東

長野県　代表校・市立長野（初優勝）
[決勝]市立長野 4-1 都市大塩尻

新潟県　代表校・帝京長岡（4年ぶり5回目）
[決勝]帝京長岡 1-0 新潟明訓

富山県　代表校・高岡一（2年ぶり3回目）
[決勝]高岡一 3-3(PK4-3)水橋

石川県　代表校・星稜（5年連続25回目）
[決勝]星稜 2-0 鵬学園

福井県　代表校・福井工大附属（2年ぶり2回目）
[決勝]福井工大附属 3-2 高志

静岡県　代表校・静岡学園（3年ぶり5回目）
[決勝]静岡学園 1-0 浜松開誠館

愛知県　代表校・刈谷（5年ぶり8回目）、中京大中京（4年連続19回目）

三重県　代表校・三重（3年ぶり3回目）
[決勝]三重 3-2(延長) 四日市中央工

岐阜県　代表校・帝京大可児（2年ぶり4回目）
[決勝]帝京大可児 0-0(PK6-5) 岐阜工

滋賀県　代表校・綾羽（初優勝）
[決勝]綾羽 1-0(延長) 比叡山

京都府　代表校・京都橘（2年ぶり3回目）
[決勝]京都橘 4-2 洛北

大阪府　代表校・大阪学院（初優勝）、履正社（2年連続3回目）

兵庫県　代表校・滝川二（2年連続23回目）
[決勝]滝川二 1-1(PK5-4) 神戸弘陵

奈良県　代表校・一条（4年ぶり6回目）
[決勝]一条 1-0 郡山

和歌山県　代表校・近大和歌山（4年ぶり11回目）
[決勝]近大和歌山 0-0(PK4-1) 和歌山北

鳥取県　代表校・米子北（9年連続12回目）
[決勝]米子北 6-0 境

島根県　代表校・立正大淞南（9年連続11回目）
[決勝]立正大淞南 2-0 明誠

徳島県　代表校・徳島市立（3年ぶり15回目）
[決勝]徳島市立 2-0 鳴門

高知県　代表校・高知商（2年ぶり7回目）
[決勝]高知商 0-0(PK5-4) 高知西

福岡県　代表校・東福岡（5年連続14回目）
[決勝]東福岡 1-0 九州国際大付

大分県　代表校・中津東（7年ぶり2回目）
[決勝]中津東 2-0 情報科学

宮崎県　代表校・日章学園（3年ぶり12回目）
[決勝]日章学園 0-0(PK8-7) 鵬翔

鹿児島県　代表校・鹿児島城西（3年ぶり6回目）
[決勝]鹿児島城西 2-0 加治木

沖縄県　代表校・那覇西（3年ぶり14回目）
[決勝]那覇西 4-2 普天間