7月28日(木)に平成28年度全国高等学校総合体育大会サッカー競技大会の二回戦が行われた。結果は以下の通り。

二回戦結果
福岡県　東福岡（5年連続14回目）　2-3　埼玉県１　昌平（初出場）
岐阜県　帝京大可児（2年ぶり4回目）　0-1　群馬県　前橋商（4年ぶり17回目）
静岡県　静岡学園（3年ぶり5回目）　5-1　香川県　香川西（5年ぶり9回目）
神奈川県２　慶應義塾（初出場）　0-0PK4-5　大阪府１　大阪学院大高（初出場）
兵庫県　滝川第二（2年連続23回目）　1-0　長崎県　長崎総科大附（4年ぶり2回目）
広島県２　瀬戸内（9年連続11回目）　0-0PK5-4　和歌山県　近大和歌山（4年ぶり11回目）
鹿児島県　鹿児島城西（3年ぶり6回目）　4-1　愛知県１　刈谷（5年ぶり8回目）
千葉県２　市立船橋（4年連続26回目）　1-0　東京都１　関東一（2年連続3回目）
島根県　立正大淞南（9年連続11回目）　2-4　青森県　青森山田（17年連続20回目）
埼玉県２　聖望学園（初出場）　2-2PK5-6　茨城県　鹿島学園（2年ぶり6回目）
北海道１　札幌大谷（2年連続4回目）　2-3　石川県　星稜（5年連続25回目）
鳥取県　米子北（9年連続12回目）　1-1PK5-4　神奈川県１　横浜創英（3年ぶり2回目）
広島県　広島皆実（3年連続14回目）　1-1PK4-5　大阪府２　履正社（2年連続3回目）
愛媛県　松山工（4年ぶり10回目）　1-2　宮崎県　日章学園（3年ぶり12回目）
山梨県　日本航空（7年ぶり2回目）　2-2PK4-3　京都府　京都橘（2年ぶり3回目）
福島県　尚志（7年連続9回目）　0-1　千葉県１　流通経済大柏（2年連続13回目）